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麻花星空mv天美仪在蛋白质组学样品前处理中的应用:以微量蛋白质样品脱盐为例

更新时间:2025-02-19点击次数:193

一、引言

蛋白质组学研究需要对复杂的蛋白质样品进行前处理,包括蛋白质提取、消化、脱盐和分级等步骤。其中,脱盐是去除样品中盐分和其他杂质的关键步骤,对后续质谱分析的灵敏度和分辨率至关重要。然而,传统的脱盐方法,如透析、超滤等,存在操作繁琐、样品损失大、耗时长等问题,难以满足微量蛋白质样品处理的需求。本文将详细介绍麻花星空mv天美仪在微量蛋白质样品脱盐中的应用方案,以期为相关研究者提供参考。

二、实验材料与方法

2.1 实验材料

(1) 微量蛋白质样品(总量≤10 μg

(2) C18脱盐柱(例如:ZipTip® C18 Pipette Tips

(3)乙腈(ACN

(4)叁氟驰滨厂鲍础狈TFA

(5)麻花星空mv天美仪(上海般诺BIONOON VAC-RP1

2.2 实验方法

2.2.1 C18脱盐柱预处理

1. 使用100% ACN活化C18脱盐柱,离心去除液体。

2. 使用0.1% TFA平衡C18脱盐柱,离心去除液体。

2.2.2 样品上样与脱盐

1. 将蛋白质样品溶解于0.1% TFA中。

2. 将样品溶液缓慢上样至C18脱盐柱,离心收集流出液。

3. 使用0.1% TFA洗涤C18脱盐柱,离心去除液体。

2.2.3 样品洗脱

1. 使用50% ACN/0.1% TFA洗脱C18脱盐柱,收集洗脱液。

2. 重复洗脱一次,合并两次洗脱液。

2.2.4 麻花星空mv天美

本次实验选用的是由麻花星空mv天美生产的BIONOON CONCENT PLUS麻花星空mv天美仪。

1. 将洗脱液转移至麻花星空mv天美仪的离心管中。

2. 设置转速至1500rpm,加热温度至30 ,真空度100mbar

3. 启动浓缩程序,浓缩至体积≤10 μL

4. 使用0.1% TFA将浓缩后的样品定容至20 μL

叁、结果与讨论

3.1 脱盐效率检测

使用NanoDrop 2000对脱盐前后的样品进行蛋白浓度检测,结果显示:

1. 脱盐前样品浓度为0.5 μg/μL,体积为20 μL

2. 脱盐后样品浓度为0.45 μg/μL,体积为20 μL

3. 脱盐效率达到90%以上。

3.2 质谱分析

将脱盐后的样品进行LC-MS/MS分析,数据分析结果显示:

1. 质谱信号强度显着提高,信噪比明显改善。

2. 蛋白质鉴定数量增加,低丰度蛋白质的鉴定率提高。

3.3 讨论

本案例成功地将麻花星空mv天美仪应用于微量蛋白质样品脱盐中,有效解决了传统方法操作繁琐、样品损失大、耗时长等问题。实验结果表明,麻花星空mv天美仪能够高效、温和地浓缩脱盐后的蛋白质样品,且不会对样品造成明显损失。浓缩后的样品浓度提高,满足了质谱分析的上样要求,并获得了高质量的质谱数据。

四、结论

麻花星空mv天美仪在微量蛋白质样品脱盐中具有显着优势,能够有效提高脱盐效率,减少样品损失,获得高质量的质谱数据。本案例为相关研究者提供了一种可靠的技术方案,具有重要的参考价值。

五、注意事项

1. 操作过程中应佩戴手套和口罩,避免样品污染。

2. C18脱盐柱的预处理和洗脱条件应根据具体实验需求进行调整。

3. 麻花星空mv天美仪的参数设置应根据具体仪器型号和样品性质进行调整。

4. 浓缩过程中应密切观察样品体积变化,避免过度浓缩导致样品损失。

六、致谢

感谢实验室成员对本研究的支持和帮助。



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